Die Kostenstellenrechnung ist eine Erweiterung der Zeiterfassung.

Zusätzlich zu den üblichen Konten der Zeiterfassung werden Kostenstellenkonten mit berechnet, wenn die "Kommt" Buchung eine Kostenstelle enthält oder dem Mitarbeiter eine Stammkostenstelle zugewiesen ist. Bei der Verrechnung wird die Kostenstelle wie ein normales Konto berechnet und in den Konten ausgewiesen. Kostenstellen können mehrstufig (Unterkostenstelle) angelegt und gebucht werden. Berechnete Kostenstellen können nachträglich aufgeteilt werden, wobei keine weiteren Buchungen nachgetragen werden muss.

Kostenstellenbuchungen können über ZE.web oder ZE.mobile getätigt werden. Über ZE.web ist eine Aufteilung der Kostenstellen soweit gefordert möglich. Kostenstellen die nicht mehr benötigt werden deaktiviert können aber jederzeit wieder aktiviert werden.